公司持有《药品生产许可证》《食品生产许可证》，现拥有药品批准文号15个、保健食品“国食健注”文号3个、食品备案企业标准11个。

公司先后获得多项重要资质与荣誉：

· 1993年6月，新疆兵团科学技术委员会批准成立新疆农垦马鹿产品综合开发研究所；

· 1999年5月，新疆农垦马鹿产品综合开发研究所获得新疆维吾尔自治区科研单位资格认定证书；

· 1999年10月，公司获评中国特产经济开发办公室“1999年度中国特产业先进集体”；

· 2002年2月，公司获得进出口企业资格；

· 2005年5月，公司通过药品GMP认证；

· 2006年5月，公司通过保健食品GMP认证；

· 2007年4月，公司“新麓”牌注册商标被评为“新疆著名商标”；

· 2008年1月，公司通过食品QS认证；

· 2015年9月，公司获得新疆兵团创新型企业称号；

· 2015年9月，新疆兵团科学技术学会同意新疆南京同仁堂健康药业有限公司成立院士工作站；

· 2016年1月，新疆维吾尔自治区科学技术学会同意成立新疆南京同仁堂健康药业有限公司院士专家工作站。

                     国家农业综合开发产业化龙头项目                                                                     院士工作站

                              马鹿产品综合开发研究所                                                                      兵团第二师马鹿协会

                                兵团技术进步二等奖                                                                             市级产品开发二等奖

                           兵团技术二等奖                                                                                               中国产学研成果奖